Xác định gen cry2A trong mẫu vi khuẩn Bacillus thuringiensis phân lập tại các tỉnh thành khu vực miền Nam Việt Nam
,
,
,
,
,
&
Article Sidebar
Main Article Content
Tóm tắt
Trong 27 mẫu phân lập vi khuẩn Bacillus thuringiensis từ một số tỉnh thành phía nam Việt Nam sinh tinh thể hình thoi có 21 mẫu dương tính với nhóm gen cry2A bằng kỹ thuật PCR. Kết quả phân tích trình tự DNA cho thấy các sản phẩm khuếch đại thuộc nhóm gen cry2A của vi khuẩn B. thuringiensis và có độ tương đồng trên 90% với các trình tự gen cry2A được công bố trên cơ sở dữ liệu gen GenBank. Sản phẩm khuếch đại của mẫu BT5 và TN7.1 với cặp primer chung cho nhóm gen cry2A có độ tương đồng lần lượt là 97 và 99%. Sản phẩm PCR của mẫu TN7.1 với cặp primer chuyên biệt cho gen cry2Aa và cry2Ab có giá trị tương đồng đạt 99% với các gen cùng nhóm đã công bố. Kết quả nghiên cứu có thể được sử dụng để dự đoán hoạt tính diệt côn trùng gây hại của các mẫu phân lập B. thuringiensis và phát triển các sản phẩm trừ sâu sinh học mới.
Article Details
Tài liệu tham khảo
Ali, G., van der Werf, W., & Vlak, J. M. (2017). Biological and genetic characterization of a Pakistani isolate of Spodoptera litura nucleopolyhedrovirus. Biocontrol Science and Technology 28(1), 20-33. https://doi.org/10.1080/09583157.2017.1409339
Baig, D. N., & Mehnaz, S. (2010). Determination and distribution of cry-type genes in halophilc Bacillus thuringiensis isolates of Arabian Sea sedimentary rocks. Microbiological Research 165(5), 376-383. https://doi.org/10.1016/j.micres.2009.08.003
Ben-Dov, E., Zaritsky, A., Dahan, E., Barak, Z., Sinai, R., Manasherob, R., Khamraev, A., Troitskaya, E., Dubitsky, A., Berezina, N., & Margalith, Y. (1997). Extended screening by PCR for seven cry group genes from field-collected strains of Bacillus thuringiensis. Applied and Environmental Microbiology 63, 4883-4890. https://doi.org/10.1128/aem.63.12.4883-4890.1997
Bravo, A., Likitvivatanavong, S., Gill, S. S., & Soberón, M. (2011). Bacillus thuringiensis: A story of a successful bioinsecticide. Insect Biochemistry and Molecular Biology 41(7), 423-431. https://doi.org/10.1016/j.ibmb.2011.02.006
Bravo, A., Sarabia, S., Lopez, L., Ontiveros, H., Abarca, C., Ortiz, A., & Quintero, R. (1998). Characterization of cry genes in a Mexican Bacillus thuringiensis strain collection. Applied and Environmental Microbiology 64(12), 4965-4972. https://doi.org/10.1128/AEM.64.12.4965-4972.1998
Crickmore, N. (2017). Bacillus thuringiensis toxin classification. In Fiuza, L. M., Polanczyk, R. A., & Crickmore, N. (Eds.). Bacillus thuringiensis and Lysinibacillus Lysinibacillus sphaericus: Characterization and use in the field of biocontrol (41-52). Cham, Switzerland: Springer International Publishing.
Dagga, A. A. M., Amnama, A. A. A., Al-Sharif, M., & Hindi, M. E. (2016). Isolation and molecular characterization of cry gene for Bacillus thuringiensis isolated from soil of Gaza strip. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences 5(4), 659-666.
Hansen, B. M., & Hendriksen, N. B. (2001) Detection of enterotoxic Bacillus Cereus and Bacillus Thuringiensis strains by PCR analysis. Applied and environmental Microbiology 67(1), 185-189. https://doi.org/10.1128/AEM.67.1.185-189.2001
Jayakumar, S., & Kaur, S. (2013). Occurrence of cry genes in Bacillus thuringiensis (Bt) isolates recovered from phylloplanes of crops growing in the New Delhi region of India and toxicity towards Diamondback moth (Plutella xylostella). Journal of Biological Sciences 13, 463-473. https://doi.org/10.3923/jbs.2013.463.473
Katara, J. L., Kaur, S., Kumari, G. K., & Singh, N. K. (2016). Prevalence of cry2-type genes in Bacillus thuringiensis isolates recovered from diverse habitats in India and isolation of a novel cry2Af2 gene toxic to Helicoverpa armigera (cotton boll worm). Canadian Journal of Microbiology 62(12), 1003-1012. https://doi.org/10.1139/cjm-2016-0042
Khojand, S., Keshavarzi, M., Zagargi, K., Abdolahi, H., & Rouzbeh, F. (2013). Presence of multiple cry genes in Bacillus thuringiensis isolated from dead cotton bollworm Heliothis armigera. Journal of Agricultural Science and Technology 15(6), 1285-1292.
Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C., & Tamura K. (2018). MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution 35, 1547-1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
Liang, H., Liu, Y., Zhu, J., Peng, G., Li, S., Wang, S., & Li, P. (2011). Characterization of cry2-type genes of Bacillus thuringiensis strains from soilisolated of Sichuan basin, China. Brazilian Journal of Microbiology 42(1), 140-146. https://doi.org/10.1590/S1517-83822011000100018
Lone, S. A., Malik, A., & Padaria, J. C. (2017) Characterization of lepidopteran-specific cry1 and cry2 gene harbouring native Bacillus thuringiensis isolates toxic against Helicoverpa armigera. Biotechnology Reports 15, 27-32. https://doi.org/10.1016/j.btre.2017.05.001
Mendoza, G., Portillo, A., Arias, E., Ribas, R. M., & Olmos, J. (2012). New combinations of cry genes from Bacillus thuringiensis strains isolated from northwestern Mexico. International Microbiology 15, 209-216. https://doi.org/10.2436/20.1501.01.174
Niu, L., Mannakkara, A., Qiu, L., Wang, X., Hua, H., Lei, C., & Ma, W. (2017). Transgenic Bt rice lines producing Cry1Ac, Cry2Aa or Cry1Ca have no detrimental effects on brown planthopper and pond wolf spider. Scientific Reports, 7(1), 1940. https://doi.org/10.1038/s41598-017-02207-z
Sauka, D. H., Amadio, A. F, Zandomeni, R. O., & Benintende, G. B. (2007). Strategy for amplification and sequencing of insecticidal cry1A genes from Bacillus thuringiensis. Antonie van Leeuwenhoek 91(4), 423-430. https://doi.org/10.1007/s10482-006-9125-3
Schnepf, E., Crickmore, N., Van Rie, J., Lereclus, D., Baum, J., Feitelson, J., Zeigler, D. R., & Dean, D. H. (1998). Bacillus thuringiensis and its pesticidal crystal proteins. Microbiology and Molecular Biology Reviews 62(3), 775-806. https://doi.org/10.1128/MMBR.62.3.775-806.1998
Silva, M. C., Siqueira, H. A. A., Marques, E. J., Silva, L. M., Barros, R., Lima Filho, J. V. M., & Silva, S. M. F. A. (2012). Bacillus thuringiensis isolates from northeastern Brazil and their activities against Plutella xylostella (Lepidoptera: Plutellidae) and Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae). Biocontrol Science and Technology 22(5), 583-599. https://doi.org/10.1080/09583157.2012.670802
Tortora, G. J., Funke, B. R., & Case, C. L. (Eds.) (2004). Microbiology - An introduction (8th ed.). San Francisco, CA, USA: Pearson Benjamin Cummings.